En el período republicano fue sede de la verdadera jura de la independencia, primera prefectura de Perú y, en el siglo XX, fue honrada como la Capital Arqueológica de Sudamérica y Patrimonio Cultural de la Humanidad. Es, además, la ciudad donde se gestaron los movimientos político-sociales más importantes de América colonial y republicana.
Un hecho histórico muy importante para Perú fue la jura de la Independencia Real, el 9 de enero de 1825, en la Plaza de Armas de Cuzco; en forma pública ante el Señor de los Temblores, por orden del primer prefecto de Perú Agustín Gamarra, y ante los altos mandos del ejército patriota y el general Simón Bolívar.
En la actualidad, Cuzco es una bella ciudad en la que conviven los fascinantes restos de la civilización inca con las construcciones típicas de la arquitectura colonial: iglesias, monasterios, conventos y palacios. Así mismo, tanto los restos precolombinos como los edificios coloniales han dejado espacio a las nuevas construcciones modernas: bares, restaurantes… Cuzco se ha convertido en un importante centro comercial del Perú y aunque ha crecido, sigue manteniendo la forma con que fue concebida por los incas, la forma de la silueta de un Puma. Desde lo alto de la colina de Sacsayhuaman se puede contemplar la mejor vista de toda su extensión.